Jauh lebih awal daripada zamannya, Akhundzade adalah penyokong yang berminat untuk pembaharuan abjad, mengiktiraf kekurangan skrip Perso-Arab berkaitan dengan bunyi Turki. Beliau memulakan kerjanya mengenai pembaharuan abjad pada tahun 1850. Usaha pertamanya tertumpu pada pengubahsuaian skrip Perso-Arab supaya ia akan lebih memenuhi keperluan fonetik bahasa Azerbaijan. Pertama, dia menegaskan bahawa setiap bunyi diwakili oleh simbol yang berasingan - tiada pertindihan atau peninggalan. Skrip Perso-Arab menyatakan hanya tiga bunyi vokal, manakala Azeri perlu mengenal pasti sembilan vokal. Kemudian, dia secara terbuka menganjurkan perubahan daripada Perso-Arab kepada abjad Latin yang diubah suai. Tulisan Latin yang digunakan di Azerbaijan antara 1922 dan 1939, dan skrip Latin yang digunakan sekarang, adalah berdasarkan versi ketiga Akhundzade.